按照唐五代时期的制度，置中书舍人六员，其中一员掌管起草诏敕的工作，称知制诰；如果以其他官员兼管这项工作，则称兼知制诰或权知制诰。韩熙载任此职，除了表明李璟对他的信任外，同时也极大地加重了他的权力。韩熙载所起草的诏诰，文字典雅，有元和之风，甚得舆论的好评。但韩熙载毕竟是书生，一旦得到重用，惟知尽心为国，全然不知如何保护自己。他任知制诰以来，感中主李璟的知遇之恩，对于朝中大事，或驳正失礼之处，或指谪批评弊端，章疏连连不断，引起朝中权要的极大忌恨与不满，尤其是宋齐丘、冯延巳的不满，使韩熙载日后的仕途充满了坎坷与艰辛。

    保大四年（公元946年）八月，枢密使陈觉擅自调发汀建抚信州军队进攻福州，李璟惟恐有失，又命王崇文、魏岑、冯延鲁等率军共同攻取福州。次年三月，由于诸将争功，加上吴越军队的增援，南唐军队大败，损失惨重。四月，李璟下诏诛杀陈觉、冯延鲁等人，在宋齐丘、冯延巳等的斡旋下，二人竟然免死。只将陈觉流放蕲州，冯延鲁流放舒州。御史中丞江文蔚上表弹劾宰相冯延巳、魏岑怂恿进攻福州，应该治罪，结果反被贬为江州司士参军。在这场战争前，南唐元老宋齐丘与冯延巳大肆鼓吹开疆拓土，对发动这场战争起到了推波助澜的作用。于是韩熙载与徐铉上表纠弹宋、冯二人与陈觉、魏岑等结为朋党，祸乱国事，并请求诛杀陈觉、冯延鲁等人，以正国法。李璟不得已贬冯延巳为太子少傅、魏岑为太子洗马，但不久魏岑就官复原职，而冯延巳却被任命为昭武军节度使。

    宋齐丘与冯延巳本来就对韩熙载不满，而韩熙载的弹劾更加深了他们的忌恨。数日后，由宋齐丘亲自出面诬告韩熙载嗜酒猖狂，其实韩熙载并不善饮酒。因为宋齐丘朋党势力甚大，李璟不得已，只好将韩熙载贬为和州司士参军，不久又调任宣州节度推官。

    在外州数年后，韩熙载才得以调回金陵重任虞部员外郎，等于转了一个大大的圆圈，又回到了最初所任的官职。其后，从员外郎逐渐升任虞部郎中、史馆修撰。因为韩熙载毕竟是中主李璟当太子时的旧僚，且颇有才华，于是李璟又给他赐紫，即可以穿三品以上官员才能穿的紫色袍服。按照唐制，六部侍郎、中书、门下侍郎等未达到三品的重要官员，如有必要，才可赐紫，而韩熙载仅是五品的郎中，便能得到赐紫，说明李璟对他仍然是信任的，同时也为进一步的提升做好了铺垫。果然不久，韩熙载又被提升为中书舍人、户部侍郎。

    自保大十三年（公元955年）以来，后周大军进攻淮南，连败南唐军队，中主李璟数次遣使求和，皆不能如愿。次年，李璟命其弟齐王李景达为诸道兵马元帅，以陈觉为监军使，率大军抵御周军。韩熙载素知陈觉志大才疏，忌贤妒能，前番统兵攻取福州损兵折将，致使南唐国力遭到很大的削弱，所以，上疏坚决反对。他说：“亲莫过亲王，重莫过元帅，何必再任命监军使！”但由于李昪在世时，曾一度有意立李景达为太子，此事虽未能实施，但毕竟在李璟心中已形成了阴影，所以把兵权交给李景达，李璟并不完全放心，这才派陈觉作为监军进行牵制。在这种情况下，韩熙载的劝谏自然不会被采纳，由于李璟的固执己见，为后来南唐军队的惨败埋下了很大的隐患。

    由于后周军队军纪败坏，所到之处，烧杀抢掠，激起了淮南人民的反抗，他们自动拿起武器，四处袭击周军；加之周世宗一度返回汴梁，南唐失去的州县又有不少相继被收复。南唐的寿州守将刘仁赡出兵攻击围城的周军得手，杀伤数万，焚毁其器械无数。在形势有利的情况下，刘仁赡派人至李景达驻扎的濠州，请求派大将边镐来守寿州，自己乘胜率军出城与周军决战。由于陈觉的干扰，刘仁赡的请求没有被批准，刘仁赡愤郁得疾。李景达虽为元帅，却处处受到陈觉的牵制，军政大权实际控制在陈觉手中，陈觉拥兵五万，却无意与周军决战，而将吏畏其权势，无人敢言。正在双方相持不下之时，却发生了南唐大将朱元叛变降敌的事件，致使局面不可收拾。

    朱元降周的经过是这样的：朱元奉命担任淮南西北面的应接都监，他连下舒、和二州，驻军紫金山。因为朱元善抚士卒，与之同甘苦，每战誓众，慷慨陈词，流涕被面，士卒皆有效死之意。陈觉与朱元不和，密奏朱元不可信，不可付以兵权，李璟听信陈觉佞言，命杨守忠前往代替朱元统军。杨守忠到前线后，陈觉以李景达的名义，召朱元至濠州议事，谋夺其兵权。朱元闻知，悲愤欲自杀，门客劝其投降后周，朱元遂率本部万馀人投降了后周。朱元的投降引起南唐诸军的崩溃，沿淮河东逃的唐军，遭事先埋伏的周军截击，死伤及投降达四万馀，抛弃的船舰器械不计其数。李景达、陈觉狼狈逃回金陵，大将边镐、许文稹、杨守忠被俘。寿州失守，守将刘仁赡忧愤而死。其馀各州守将纷纷弃城而逃，后周战舰直入长江，布列江面。南唐彻底战败，只好割让淮南十四州给后周，并称臣纳贡。

    中主李璟不听韩熙载的劝谏，终于酿成战败的大祸。从此南唐积贫积弱，处于被动挨打的局面。为了躲避中原王朝的威胁，李璟被迫迁都洪州（今江西南昌），郁郁寡欢，一病而亡。

    后主李煜即位后，任命韩熙载为吏部侍郎、兼修国史。不久因改铸钱币之事，韩熙载与宰相严续争论于御前，韩熙载辞色俱厉，声震殿廷。后主因其失礼，改授秘书监。不到一年，再次任命他为吏部侍郎，并升任兵部尚书、充勤政殿学士承旨。后又因其旷达不羁，放纵声色，被人弹劾，贬为太子右庶子、分司南都，即于洪州安置。韩熙载上表乞哀，于是又被留了下来，重任旧职。

    这一时期，韩熙载仍不改其狂傲的性格，由于后主李煜生性宽仁厚爱，凡事皆能容忍，君臣之间尚能相安无事。比如后主纳小周后时，在宫中大宴群臣，韩熙载却赋诗讽刺，而李煜却未加谴责。有一次，李煜在青龙山狩猎，返回金陵后，亲自到大理寺复核所关押的囚犯，多有赦免者。韩熙载再次上书，认为此事有司法部门负责，监狱非君主所应入之地，要求后主自罚钱三百万以充军费。后主也没有怪罪于他。开宝元年（公元968年）五月，韩熙载撰成《格言》五卷、《格言后述》三卷，进献给李煜。李煜读后非常赏识，遂升任他为中书侍郎、充光政殿学士承旨，这是韩熙载生前所任的最高官职。